Terra Natura té una preocupació constant per la salut i el benestar animal, disposa d'un equip veterinari especialitzat en fauna salvatge que atén tots els animals del parc els 365 dies de l'any. La tasca se centra fonamentalment en la medicina preventiva, tractaments específics i en el control nutricional i reproductiu de la col•lecció. Per a portar a terme este objectiu, té a la seua disposició els recursos adequats i la tecnologia més avançada per al diagnòstic, el tractament i la prevenció de malalties.
L'àrea veterinària està dividida en tres zones: una zona administrativa, un edifici de quarantena i una clínica veterinària completament equipada.
La clínica veterinària té un ampli quiròfan proveït d'equipament mèdic molt modern, un prequiròfan, una àrea per a raigs X, un laboratori, una farmàcia, una sala d'hospitalització i una altra de cures neonatals. En el laboratori es realitzen anàlisis de sang, parasitàries, microbiològiques i estudis d'histopatologia, que es duen a terme de manera rutinària en tots els animals de Terra Natura per tal de controlar-los la salut. En la clínica també hi ha una zona exclusiva per a realitzar necròpsies (la qual cosa permet un acurat estudi de les malalties), i disposa d'un banc de mostres que s'emmagatzemen amb vista a possibles estudis posteriors.
L'edifici de quarantena, ubicat davant de la clínica, disposa d'una gran varietat d'instal•lacions dissenyades per tal de mantindre les diferents espècies d'animals: des de xicotetes aus fins a grans mamífers. Quan arriben al parc, tots els animals es mantenen 30 dies en quarantena, període durant el qual s'analitzen i es revisen per assegurar-nos que estan lliures de paràsits o malalties infeccioses que puguen transmetre a altres animals.
El treball de l'equip veterinari continua en el parc: visiten els animals en les respectives instal•lacions per examinar-los o tractar-los en cas necessari. Molts dels tractaments i procediments senzills es porten a terme en la instal•lació de l'animal, ja que en el seu entorn habitual este se sent més tranquil. Si es tracta de procediments més complexos, com ara cirurgia, examen radiològic, etc., els animals es traslladen a la clínica veterinària. A vegades resulta més senzill traslladar a la instal•lació de l'animal tot l'equip i material necessari per a un procediment, que traslladar animals com ara rinoceronts indis o elefants a la clínica veterinària.